| 1796年 |
| シーボルト、神聖ローマ帝国の司教領ヴュルツブルクに、数々の学者を輩出している家の長男として生まれる。父が早世したため、母方の叔父に育てられる。 |
| 1815年 |
| ヴュルツブルク大学に入学。医学、植物学、地理学を学ぶ。 |
| 1820年 |
| 国家試験を受け、ハイディングスフェルト村で医者として開業する。 |
| 1822年 |
| オランダ領東インド陸軍病院の外科少佐として採用される。 |
| 1823年 | 文政6年 | ジャワ島到着（4月）。6月に来日。 |
| 1824年 | 文政7年 | シーボルト、長崎郊外に私塾兼診療所を設ける。高野長英、二宮敬作、伊東玄朴、戸塚静海など50人以上の門下生がここで西洋医学や自然科学などを学びながらシーボルトの日本研究に協力する。 |
| 1826年 | 文政9年 | シーボルト、オランダ商館長の江戸参府に随行し、数々の蘭学者、大名などと交流する。ケンペル、ツンベリーなど研究熱心な以前の商館医と同様にシーボルトは、この旅で資料及び情報の収集を行う。 |
| 1827年 | 文政10年 | 楠本瀧とシーボルトの娘イネ（1827-1903）誕生。後に日本人初の、女性で西洋医学を学んだ産科医となる。 |
| 1828年 | 文政11年 | 帰国する直前、シーボルトの所持品の中に幕府禁制の日本地図などが見つかり、いわゆるシーボルト事件が勃発。国外追放処分となる。 |
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| 1846年 | 弘化3年 | 長男アレクサンダー（1846-1911）誕生。 |
| 1852年 | 嘉永5年 | 次男ハインリッヒ（1852-1908）誕生。 |
| 1858年 | 安政5年 | 日蘭通商条約の締結によりシーボルトの追放が解除となる。 |
| 1859年 | 安政6年 | シーボルト、オランダ貿易会社顧問として再来日。息子アレクサンダーとハインリッヒを同伴。 |
| 1861年 | 文久1年 | シーボルト、対外交渉のための幕府顧問となる。 |
| 1862年 | 文久2年 | 後にシーボルトの孫娘の婿となる三瀬諸淵（1839-1877）が、シーボルトのために日本の歴史書を翻訳した罪で逮捕される。 |
| 1862年 | 文久2年 | シーボルトが持参した文献に日本で入手した文献を加え、出島で蔵書目録を出版する。 |
| 1862年 | 文久2年 | シーボルト、官職を辞して帰国。 |
| 1866年 | 慶応2年 | ドイツ・ミュンヘンで死去、享年70。 |
